Samodzielny Publiczny Zakład Opieki Zdrowotnej w Krotoszynie świadczenia zdrowotne zakontraktowane przez Narodowy Fundusz Zdrowia realizuje obecnie w 10 budynkach.
W Szpitalu Powiatowym im. Marcelego Nenckiego przy ul. Mickiewicza 21 w Krotoszynie znajdują są:
- Szpitalny Oddział Ratunkowy z Zespołami Ratownictwa Medycznego i Izbą Przyjęć
- Oddział wewnętrzny z pododdziałem kardiologicznym
- Oddział chirurgiczny z pododdziałem urazów narządu ruchu i ortopedii
- Oddział anestezjologii i intensywnej terapii
- Oddział położniczo-ginekologiczny z traktem porodowo-operacyjny
- Oddział dziecięcy
- Oddział noworodkowy
W tym budynku jest także Blok Operacyjny z Centralną Sterylizatornią oraz Laboratorium Centralne. Przy szpitalu znajduje się lądowisko dla śmigłowców Lotniczego Pogotowia Ratunkowego. Swoje budynki ma także kolumna sanitarna i apteka szpitalna.
Druga pod względem wielkości lokalizacja budynków szpitalnych znajduje się w kompleksie obiektów przy ul. Bolewskiego 4-8.
W budynku szpitala z początków XX w. znajduje się obecnie Pracownia RTG.
Obok znajduje się nowoczesna Stacja Dializ im. dr. Władysława Bolewskiego.
Oddział Onkologii Klinicznej funkcjonuje w następnym budynku przy ul. Bolewskiego, w którym znajdują się również poradnie specjalistyczne:
- alergologiczna
- chirurgiczna
- diabetologiczna
- położniczo-ginekologiczna
- kardiologiczna
- nefrologiczna
- onkologiczna
- ortopedyczna
- reumatologiczna
- urologiczna
- pracownia mammograficzna
Na ul. Bolewskiego 4-8 znajduje się także Zakład Rehabilitacji (rehabilitacja ambulatoryjna).
W budynku przy ul. Bolewskiego 14 mieszczą się: Zakład Opiekuńczo-Leczniczy i Zakład Opieki Paliatywnej.
Oddział rehabilitacyjny z pododdziałem rehabilitacji neurologicznej znajduje się natomiast w Szpitalu Powiatowym przy ul. Stęszewskiego 9-10 w Koźminie Wlkp.
Budynek administracji SPZOZ zlokalizowany jest przy ul. Młyńskiej 2 w Krotoszynie.